Лучше всего использовать счетчики метрики Яндекса и Гугл, так как это две основные поисковые системы, если вы будете использовать какие то дополнительные системы, то знайте на перед они могут враждовать между друг другом, из-за этого вам придется, под каждую систему аналитики создавать свои правильные страницы, чтобы индексация была в порядке.